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Des interactions protéines-acides nucléiques (ADN/ARN) ont lieu tout au long de la vie de la cellule végétale, notamment pour réguler des processus cellulaires tels que l’expression génique. Les méthodes classiques pour analyser des interactions de ce type sont généralement basées sur des approches in vitro, limitant l’obtention d’informations spatio-temporelles.

Étudier les interactions in vivo

L’idée est ici de faire produire aux cellules végétales une version fluorescente de la protéine d’intérêt, en la fusionnant à une molécule conférant la fluorescence nommée GFP et de marquer en parallèle les acides nucléiques de la cellule à l’aide d’une autre molécule fluorescente, le SYTOX Orange. Si une interaction entre la protéine d’intérêt et l’acide nucléique a lieu, une réduction significative de la durée de vie de la GFP est mesurée : c’est l’effet FRET, ou transfert d’énergie entre une molécule fluorescente donneuse (GFP) et une molécule fluorescente accepteuse (SYTOX Orange) fixée aux acides nucléiques.

Pour pouvoir capter et acquérir les informations en temps réel malgré la rapidité de ce phénomène, un microscope particulier est nécessaire : c’est là qu’intervient la technologie Fluorescence Life Time Imaging Microscopy (FLIM) qui permet cette acquisition rapide.

Cette nouvelle méthode représente un outil très prometteur pour mieux appréhender les mécanismes biologiques mis en place par les plantes tout au long de leur cycle de vie.