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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Visiting Scientists workshop par Federico Ariel

"Put your 3D glasses on: Chromatin is on show. Chromatin-related techniques to decipher nucleus organization"

Visiting Scientists workshop par Federico Ariel
Federico Ariel – de l'Instituto de Agrobiotecnología del Litoral in Santa Fe, Argentina – animera un WORKSHOP TULIP le jeudi 15 décembre de 14h à 17h en salle FR-40 !

Hébergé au sein du LIPM du 1er au 18 décembre en tant que "Visiting Scientist" financé par TULIP, Federico fera la présentation d'une large variété de techniques biochimiques impliquant la chromatine, incluant ChIP, RIP, ChIRP and 3C. Finalement il intégrera l'usage de ces différentes approches dans le contexte de son travail sur la conformation 3D dynamique de la chromatine et son impact sur l'activité génomique chez Arabidopsis thaliana.

Figure3BFedericoAriel

(B) APOLO transcription by Pol II and Pol V controls chromatin loop dynamics to fine-tune promoter activity of the neighboring gene PID. (i) Auxin activates APOLO DNA demethylation and ‘opens’ the loop encompassing the PID promoter region. (ii) Pol II divergent transcription leads to increased accumulation of PID and APOLO RNAs. Pol II APOLO transcripts gradually recruit PRC1 components (blue balls) to mediate loop ‘closing’. Pol V transcripts are recognized by AGO4 loaded with Pol IV-derived 24 nt siRNAs and trigger DNA methylation (‘m’). (iii) Pol II APOLO- mediated loop is finally re-formed and stabilized by Pol IV/Vdependent DNA methylation, downregulating levels of PID transcripts. PID exons are represented in green, the APOLO locus in red, and RNAs are red arrows. Transcription start-sites are indicated by black arrows. Model based on [95].