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Les éponges marines hébergent des communautés complexes de micro-organismes qui contribuent à leur santé et à leur survie, mais les mécanismes à la base de l'assemblage du microbiome sont en grande partie inconnus. Dans cet article, les chercheurs ont présenté le réseau mondial d'éponges et de microbiomes marins. Ils révèlent une organisation modulaire, à la fois en termes de structure et de fonction des communautés. Les modules sont liés par quelques espèces d'éponges qui partagent des microbes avec d'autres espèces du monde entier.

Les auteurs ont également pu apporter la preuve que tous les microbes présents sont influencés par des facteurs abiotiques (facteurs physico-chimiques de l’écosystème) qui influencent la structuration du microbiome de l’éponge, mais que les interactions biotiques (action des organismes vivants sur le vivant) conditionnent l’assemblage de micro-organismes «de base» plus intimement associés.

Ces résultats suggèrent que des processus écologiques et évolutifs sont en jeu dans l'assemblage du réseau hôte-microbe. Les auteurs s’attendent à ce que les mécanismes impliqués dans cet assemblage soient cohérents sur tous les hôtes multicellulaires de l'arbre de la vie.