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Labex TULIP

Projets New frontiers

L’objectif de cet appel à projets est de soutenir les projets repoussant les frontières de nos thématiques, ayant éventuellement une certaine prise de risque et ne correspondant pas encore à des projets déposables auprès de l'ANR ou des programmes similaires.

Une enveloppe annuelle de 150 k€/an est dédiée à cet appel à projets et utilisable pour toutes dépenses : fonctionnement, subcontracting, missions, colloques, personnel. Seul l'équipement (investissement) n'est pas prévu. Peu de projets sont retenus (2 à 5 projets maximum) afin d'atteindre un bon niveau de financement par projet, dont la durée pourra être d'un ou deux ans maximum. Cet appel a été ouvert en 2012, 2014, 2016 et 2018. Dans le passé, il a déjà permis de soutenir 15 projets après sélection par notre Conseil scientifique international (ISB).

Année 2018

Responsable du projet

Intitulé du projet

Unité

Caroline Baroukh

Metabolic modelling of A Plant Pathogen Interaction (MAPPI)

LIPM

Simon Blanchet

The contribution of intraspecific diversity to ecosystem functioning

SETE

Fabrice Roux

A citizen project for establishing a genomic map of local adaptation in Arabidopsis thaliana to climate, soil and microbiota (OPTIMA)

LIPM

Résumé du projet de Caroline Baroukh

Modélisation métabolique d'une interaction plante-pathogène (MAPPI)

« Dans ce projet, nous proposons d'utiliser une combinaison d’approches de modélisation et d'approches expérimentales pour déchiffrer l'interaction métabolique entre plante et agent pathogène. Nos objectifs sont de mieux comprendre l’adaptation métabolique développée par le pathogène une fois à l’intérieur de la plante, de savoir quels substrats de la plante favorisent la croissance du pathogène et de déterminer les voies potentiellement ciblées par le pathogène pour augmenter ses compétences métaboliques. Les organismes modèles utilisés seront l'agent pathogène bactérien Ralstonia solanacearum et la tomate, plante d’intérêt agronomique (Lycopersicum esculentum). Pour obtenir une représentation précise du système phytopathogène et des prédictions précises, des expériences seront nécessaires pour calibrer le modèle. Le budget sera principalement utilisé à cette fin, via l’engagement d’un assistant de recherche. »

Résumé du projet de Simon Blanchet

Contribution de la diversité intraspécifique au fonctionnement des écosystèmes

« Le projet se concentre sur trois espèces d'eau douce en interaction dans un réseau trophique et combine des approches empiriques et expérimentales. Une première tâche consiste à déterminer si la diversité intraspécifique contribue de manière substantielle au fonctionnement de l'écosystème à l'état sauvage. À l'aide de données d'observation recueillies le long d'un gradient climatique, nous quantifierons les effets de la diversité intraspécifique sur les fonctions écologiques clés, comparerons la force des FF intraspécifiques entre les espèces cibles et comparerons la contribution de la diversité intraspécifique au fonctionnement de l'écosystème à celle du climat. Dans un deuxième temps, nous allons définir une expérience faisant varier la diversité intraspécifique et le climat afin de dissocier les effets directs dus à cette diversité intraspécifique et le climat, ainsi que les effets indirects du climat induits par la diversité intraspécifique sur le fonctionnement de l'écosystème. Ce projet devrait déboucher sur un nouveau cadre intégratif reliant les facteurs abiotiques, la diversité intra et interspécifique et les fonctions écosystémiques. »

Résumé du projet de Fabrice Roux

Projet citoyen visant à établir une carte génomique de l'adaptation locale d'Arabidopsis thaliana au climat, au sol et au microbiote (OPTIMA)

« Ce projet vise à établir une carte génomique de l’adaptation locale de la plante modèle Arabidopsis thaliana aux propriétés physico-chimiques du sol et au microbiote du sol ainsi qu’au climat. Pour atteindre cet objectif, nous allons combiner (i) les avantages de l'analyse de génétique d’'association génome-environnement basée sur 168 populations naturelles d'A. thaliana dont le génome a été séquencé et situées dans le sud-ouest de la France ; et (ii)   la mise en œuvre d’un projet citoyen unique qui permettra d’estimer la performance de toutes ces populations dans 60 jardins communs. Ce projet exploratoire représente une opportunité passionnante d’estimer l’importance relative des facteurs abiotiques et biotiques sur l’ampleur de l’adaptation locale chez A. thaliana et de mener des recherches prospectives sur l’identification de nouveaux mécanismes fonctionnels sous-jacents à l’adaptation locale de la plante. »

Année 2016

Responsable du projet

Intitulé du projet

Unité

Laurent Deslandes & Nemo Peeters

Explore Plant integrated decoy diversity to trap Ralstonia solanacearum type III effectors

LIPM

Benjamin Gourion

Risks associated with nodulation (possibility that it can be exploited by pathogens)

LIPM

Jean-Philippe Combier

Function and comparative analysis of microRNA-encoded petides in plants and animals

LRSV

Jean-Baptiste Ferdy

Adaptation of pathogens to host microbiomes

EDB

Année 2014

Responsable du projet

Intitulé du projet

Unité

Benoit Pujol

Predicting the ability of wild populations to adapt as a function of non genetic inheritance (PAW)

EDB

Sylvain Raffaele

Virulence function and evolution of Sclerotinia signals manipulating plant RNA silencing pathways (ScleRNAi)

LIPM

Alexis Chaine

Human Altruism Genes

SETE

Année 2012

Responsable du projet

Intitulé du projet

Unité

Stéphane Genin

Etude du réseau métabolique de Ralstonia solanacearum et de sa dynamique lors de l'infection des plantes

LIPM

Guillaume Becard

Importance écologique des lipochitooligosaccharides comme molécules de signalisation dans les interactions biotiques des plantes

LRSV

Catherine Masson

Facteurs environnementaux et génétiques déclenchant une hypermutabilité au cours de l'évolution expérimentale des symbiotes de légumineuses

LIPM

Etienne Danchin

Hérédité sociale (SOC-H²)

EDB

André Pornon & Christophe Andalo

Étude des réseaux d'interactions plantes-pollinisateurs par code-barres à ADN (POLLIBAR)

EDB

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