Patrícia Beldade rejoindra le périmètre du LabEx TULIP au cours du premier trimestre 2016. Grace à un package junior et une expérience internationale, elle y développera une approche scientifique novatrice au sein du laboratoire EDB et du Labex.
Supprimer les réponses immunitaires de l'hôte compte parmi les actions essentielles des agents pathogènes. Cependant, comme tout mécanisme moléculaire, il n’est ni infaillible ni sans danger. Il le reste jusqu'à ce que l'hôte évolue, trouve le talon d'Achille et mette en place une riposte adaptée. Les chercheurs du LIPM, en collaboration avec une équipe chinoise, sont non seulement parvenus à décrypter de nouveaux mécanismes immunitaires, fruits de millions d’années de coévolution entre plantes et bactéries, mais également à assembler ces derniers autour d'un nœud prenant la forme d’un véritable pivot de l'immunité végétale. Ce travail a été publié dans Cell Host & Microbe.
L’écologie considère habituellement que la biomasse de prédateurs d’un écosystème varie proportionnellement à celle de leurs proies. Une étude publiée le 4 septembre dans Science par une équipe franco-canadienne vient pour la première fois contredire cette théorie. En s’appuyant sur une base de données de plus de 2000 communautés d’espèces, les scientifiques ont en effet constaté que la biomasse totale des proies augmentait bien plus vite que celle des prédateurs et selon des proportions similaires pour la totalité des écosystèmes analysés. De tels résultats suggèrent que les écosystèmes possèdent un degré d’organisation bien plus grand que celui qu’on leur prêtait jusqu’alors.
Afin de se prémunir des attaques de leurs prédateurs, de nombreuses plantes de la famille des crucifères ont acquis une redoutable défense. Ce genre de poison, appelé « mustard oil bomb » en raison de sa prévalence chez la moutarde, n’a d’effets que lorsque la plante est consommée par un brouteur. Travaillant sur les bases génétiques de ce cocktail toxique chez la plante modèle A. thaliana, un groupe de chercheurs menés par J. Bergelson (Université de Chicago) et F. Roux (LIPM) ont réalisés une découverte surprenante. Cette défense, fruit de la sélection naturelle, n’est efficace qu’avec de très rares combinaisons de 3 gènes indépendants. En dépit de cela, plusieurs populations de plantes se dessinent pourtant en Europe de l’Ouest, signifiant un véritable « saut évolutif » pour passer directement d’une combinaison gagnante à une autre…
Outre leur diversité, les arbres Amazoniens occupent une place prépondérante dans le cycle du carbone. Par leur croissance et en dépit de la mortalité, ils stockent plus de carbone organique dans leur biomasse qu’aucun autre écosystème sur terre. L’extraordinaire diversité des forêts Amazoniennes dissimule cependant le fait que cette abondance d’espèces est fortement biaisée en faveur de quelques espèces « hyper-dominantes », espèces dont la fréquence est largement supérieure aux autres.
De nombreuses espèces animales vivent en meutes, couples, colonies… Pour autant, en regard d’espèces où les individus demeureraient isolés, s’il y a bien des avantages à de telles organisations sociales telles que la capture de proies ou la défense contre les prédateurs, elles présentent également des désavantages tels que faciliter la circulation de parasites et autres agents pathogènes. Afin de comprendre l’utilité ou les conséquences génétiques de ces « structures sociales », Bárbara Parreira, étudiante de thèse à l’Instituto Gulbenkian de Ciência et L. Chikhi (EDB / Instituto Gulbenkian de Ciência / LabEx TULIP / LIA BEEG-B) ont étudié l’influence de la structure sociale sur la variabilité génétique des individus et donc, sur le potentiel d’adaptation des populations.
Camouflage, vitesse, illusion d’optique… Le règne animal regorge de stratégies permettant aux prédateurs de capturer leurs proies ou, inversement, à ces dernières de leur échapper. Il est cependant moins aisé de penser que de telles stratégies ont pu être déployées à d’autres échelles… telles qu’à l’intérieur même de cellules ! C’est pourtant un mécanisme surprenant qui a été découvert par un groupe de chercheurs mené par Laurent Deslandes (LIPM – INRA / CNRS) : une bactérie pathogène court-circuite les défenses des cellules végétales en empêchant le déclenchement du « signal d’alarme ». Plus étonnant encore, les cellules végétales ont en retour développé un leurre destiné à prendre l’envahisseur à son propre piège. Récit d’une découverte aux potentialités multiples publiée ce 21 mai dans la prestigieuse revue Cell.
A l'occasion de la venue de deux chercheurs de renom, David S. Guttman & Darrell Desveaux, tout deux de l'université de Toronto, département de cellules et systèmes biologiques, assureront la tenue de deux séminaires. Une table ronde, réservée aux Masters, PhD, Post-docs... permettra de plus des discussions avec ces scientifiques dans un cadre plus convivial.
Frans J. De Brujin, chercheur au LIPM, vient de publier deux ouvrages faisant le point sur la fixation de l'azote chez les plantes. Biological Nitrogen Fixation est un ouvrage couvrant le vaste spectre de la fixation de l’azote chez les plante. Il propose à la fois une rétrospective synthétique des connaissances accumulées dans le domaine depuis des dizaines d’années sans pour autant négliger les recherches récentes. L’accent est ici mis sur les approches par les techniques moléculaires et les analyses biochimiques.
Les microARN sont depuis longtemps considérés comme des molécules jouant un rôle dans la régulation de l’expression des gènes. En revanche, les molécules à leur origine, les transcrits primaires, si ce n’est constituer une étape intermédiaire dans l’élaboration de ces microARN ont toujours été jugés comme dénués de toutes fonctions. En révélant le rôle de ces transcrits, une équipe du LRSV (UT3 / CNRS) à l’origine de cette découverte vient non seulement d’abattre un dogme ayant résisté plus de 20 ans mais également de révéler des applications insoupçonnées… ayant déjà fait l’objet de plusieurs brevets.
Dans le cadre du cycle de conférences Les Sciences pour Tous organisé par le service communication de l'Inra-Auzeville, Mehdi Khafif, ingénieur au sein du Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes (LIPM), présentera la plateforme « Toulouse Plant Microbe Phenotyping » (TPMP) dédiée au phénotypage automatisé à haut débit d’analyse et en conditions contrôlées d'espèces végétales et microbiennes.
L’Amazonie est en train de perdre sa capacité à absorber le dioxyde de carbone (CO2) atmosphérique, principal gaz à effet de serre. C’est le résultat d’un inventaire colossal : le suivi, sur une trentaine d’années, de la biomasse contenue dans 321 parcelles de forêt amazonienne. Il révèle que le taux de mortalité des arbres a augmenté de plus d’un tiers depuis le milieu des années 1980, diminuant la capacité de stockage du CO2 par la forêt tropicale. L’étude implique presque 100 chercheurs du réseau Rainfor1 sous la direction de l’université de Leeds, dont des chercheurs français du Cirad, du CNRS et de l’Inra, collaborant au sein du Labex CEBA.
Avec une superficie mondiale de 20 millions d’hectares de plantations industrielles, les Eucalyptus sont les feuillus les plus plantés au monde. Aujourd’hui encore essentiellement destinés à la production de pâte à papier, ces arbres à la croissance rapide représentent une importante source de biomasse renouvelable et pourraient constituer, au travers des biocarburants de deuxième génération, une réponse aux demandes croissantes en énergie. Compte tenu des enjeux économiques considérables, mais aussi des enjeux sociaux et écologiques que représentent les plantations d’Eucalyptus, il est crucial de comprendre comment ceux-ci fabriquent leur « bois », résistent à des conditions climatiques contraignantes ou à des bio-envahisseurs. C’est dans cette optique qu’un consortium international impliquant l’équipe « génomique fonctionnelle de l’Eucalyptus » au LRSV (CNRS/UPS) menée par J. Grima-Pettenati, vient de décrypter le génome d’Eucalyptus grandis, véritable « Atlas » des possibilités que réserve cette espèce.
Un consortium international publie dans Nature Genetics le séquençage de 13 nouveaux génomes de champignons symbiotiques mycorhiziens. Par son ampleur, cette avancée a permis de reconstruire l'histoire évolutive des champignons depuis leurs ancêtres, qui avaient vocation à décomposer et consommer le bois (pourriture blanche puis brune) jusqu’à l’établissement des mécanismes de symbiose nécessitant donc de leur part un changement complet de stratégie. Ce vaste projet a été soutenu par le LabEx TULIP via les chercheurs réunis dans le « Mycorrhizal Genome Consortium ».
En mai prochain le laboratoire EDB recevra, grâce au programme « Visiting scientist » du LabEx TULIP, un invité de renom en la personne du Pr. Pierre Legendre. Cet enseignant-chercheur, des plus prolifiques (auteur de 433 publications et cité plus de 47000 fois) a largement contribué au virage ayant conduit à l’écologie actuelle, dite « numérique ». Une de ses œuvres, « Numerical Ecology », véritable bible en la matière, intègre l'acquis de nombreuses disciplines mathématiques dans un schéma général d'analyse de données écologiques. P. Legendre, basé à l’université de Montréal depuis 1980, viendra donc exceptionnellement sur Toulouse, au sein du laboratoire EDB, pour une durée de 3 mois (7 Avril / 27 Juin) afin d’échanger avec les chercheurs et étudiants des différents laboratoires membres du LabEx. Quatre séminaires sont d'ores et déjà prévus.
Cette nouvelle édition du meeting de TULIP permettra de faire un point sur l'état d'avancement des projets centraux, au cœur de la stratégie scientifique du LabEx. Outre ces différentes interventions, le colloque sera également l'occasion d’accueillir Armin Djamei (Gregor Mendel Institute, Austria) et Alexandre Roulin (Université de Lausanne) et de faire un point sur l'intégration du LabEx dans le paysage local (IDEX UNITY & TTT) ou national (ANR). Les inscriptions sont ouvertes au personnel des laboratoires membres de TULIP ainsi qu'aux partenaires du LabEx.
Que vous terminiez votre master, que vous soyez en thèse ou en post-doctorat, postulez pour un programme scientifique unique, dans un cadre d'exception au pied du Pic du Midi de Bigorre. Cette école d'été, mêlant biologie végétale et écologie, accueillera jusqu'à 25 étudiants...
Ce colloque transdisciplinaire rassemble des chercheurs du monde entier afin de discuter des dernières avancées sur la manière dont les plantes interagissent, communiquent, apprennent, se développent, ressentent leur environnement et survivent dans un milieu en pleine évolution. Il vise notamment à favoriser les interactions transdisciplinaires entre biologistes végétaux, cellulaires, écologistes des plantes ainsi que tous les chercheurs intéressés par ce vaste domaine.
Le LabEx TULIP soutient le colloque ICAR ( International Conference on Arabidopsis Research) 2015. Cette 26ème édition prendra place au palais des congrès à Paris du 5 au 9 juillet prochain.
Soumises à des pressions de sélections réciproques, les plantes et les agents pathogènes qui leur sont associés se livrent à une course à l’armement. Chaque nouvelle stratégie offensive déployée par un virus ou une bactérie finit en effet par trouver son pendant défensif chez l’espèce végétale concernée. Cette « règle » vient cependant d’être contredite par une observation des plus étranges : chez une espèce végétale des plus banales, un gène de résistance à l’encontre d’un agent pathogène est maintenu depuis des millions d’années dans la nature… alors que cet agent est quasiment absent de toutes les plantes de l’espèce concernée… En résolvant cette énigme, les travaux de chercheurs impliquant le LIPM (INRA/CNRS), mènent à un point de vue riche en enseignements.
Que ce soit dans l’eau, l’air, le sol ou même les organismes, les bactéries ont colonisé tous les milieux. Le « microbiome », ensemble des microorganismes auxquels un individu est exposé, est cependant aussi bien composé de bactéries indispensables à notre survie que de bactéries nocives. Afin de permettre aux êtres vivants de favoriser les unes et de réguler les autres, des mécanismes de contrôle de ce microbiome ont évolué. Des chercheurs du laboratoire EDB (Évolution et Diversité Biologique - CNRS / UT3 / ENFA) se sont demandés comment la plus commune des mésanges eurasiatiques, la mésange charbonnière, régule son microbiome et, en retour, les effets que celui-ci peut induire sur l’oiseau… ainsi que sur sa descendance.
